MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	T	7	7	1387	1393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022665	A	6	6	1394	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022665	T	6	6	1405	1410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022665	TCA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022665	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022665	ATA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022665	ATA	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022665	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022665	TA	3	6	2733	2738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022665	TA	4	8	2764	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022665	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022665	CATAT	2	10	2808	2817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022665	AAAG	2	8	2826	2833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022665	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022665	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022665	GAG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022665	A	10	10	4391	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022665	TTC	2	6	5535	5540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022665	GTT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022665	GAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022665	TTGG	2	8	5629	5636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022665	AAT	2	6	9767	9772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022665	AGG	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022665	AAC	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022665	CTA	2	6	13649	13654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022665	T	6	6	15723	15728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022665	TTAT	2	8	15779	15786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022665	A	6	6	15871	15876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022665	CAA	2	6	15950	15955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022665	GAA	2	6	16538	16543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022665	A	6	6	16554	16559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022665	A	6	6	16588	16593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022665	A	6	6	16598	16603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022665	TA	3	6	16617	16622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022665	A	7	7	16676	16682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022665	GTT	2	6	16825	16830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022665	AGA	2	6	16868	16873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022665	ACAAA	2	10	16920	16929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022665	GGC	2	6	17013	17018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022665	G	6	6	17119	17124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022665	GCA	2	6	17334	17339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022665	CGC	2	6	17381	17386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_022665	GTGA	2	8	17387	17394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022665	TGT	2	6	17420	17425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022665	AGA	2	6	17429	17434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022665	AGA	2	6	17441	17446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022665	CAG	2	6	17503	17508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022665	AGCG	2	8	17558	17565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022665	AT	3	6	17687	17692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022665	GGA	2	6	17693	17698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022665	CT	3	6	17718	17723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022665	GAA	2	6	17957	17962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022665	GGT	2	6	18031	18036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022665	GTC	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022665	TCGTG	2	10	18054	18063	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022665	CAT	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022665	TAA	2	6	18148	18153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022665	GGA	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022665	ATC	2	6	18181	18186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022665	AC	3	6	18208	18213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022665	CGC	2	6	18347	18352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_022665	AC	3	6	18377	18382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022665	CAC	2	6	18392	18397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022665	AGCC	2	8	18440	18447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022665	GAT	2	6	18463	18468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022665	CCT	2	6	18519	18524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_022665	TCT	2	6	18554	18559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022665	AGG	2	6	18620	18625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022665	AAC	2	6	18655	18660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022665	GTT	2	6	18665	18670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022665	A	6	6	18800	18805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022665	TAA	2	6	18812	18817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022665	GTTAA	2	10	18819	18828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022665	AAC	2	6	18881	18886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022665	GTAA	2	8	18905	18912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022665	TCAC	2	8	18962	18969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022665	TAG	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022665	GCGA	2	8	19061	19068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022665	AGG	2	6	19075	19080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022665	GAG	2	6	19088	19093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022665	CTC	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022665	AGA	2	6	19140	19145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022665	AG	3	6	19168	19173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022665	TCG	2	6	19243	19248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022665	GGA	2	6	19256	19261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022665	CT	3	6	19282	19287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022665	ACA	2	6	19374	19379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022665	ATG	2	6	19441	19446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022665	TAT	2	6	19506	19511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022665	GGA	2	6	19574	19579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022665	TC	3	6	19660	19665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022665	ACC	2	6	19840	19845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022665	AAT	2	6	19860	19865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022665	AGC	2	6	19920	19925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022665	ATTC	2	8	19927	19934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022665	TG	3	6	20051	20056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022665	AAG	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022665	GAG	2	6	20072	20077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022665	GA	3	6	20202	20207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022665	ACA	2	6	20228	20233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022665	CTAA	2	8	20283	20290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022665	GA	3	6	20498	20503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022665	CT	3	6	20614	20619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022665	GAT	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022665	AGG	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022665	CGG	2	6	20723	20728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022665	GA	3	6	20821	20826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022665	TAGG	2	8	20939	20946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022665	TAC	2	6	20993	20998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022665	CCT	2	6	21081	21086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022665	GGT	2	6	21217	21222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022665	TCG	2	6	21332	21337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022665	CGT	2	6	21412	21417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022665	GA	3	6	21636	21641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022665	TGGAAG	2	12	21659	21670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022665	T	6	6	21799	21804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022665	AGT	2	6	21905	21910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022665	CAG	2	6	21956	21961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022665	AGT	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022665	AATC	2	8	22187	22194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022665	ATAGA	2	10	22381	22390	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022665	ACC	2	6	22505	22510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022665	CGT	2	6	22542	22547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022665	ATTAT	2	10	22856	22865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022665	CGC	2	6	22935	22940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_022665	TA	3	6	22941	22946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022665	AT	3	6	23032	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022665	GGA	2	6	23039	23044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022665	GCGT	2	8	23098	23105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022665	TCC	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_022665	CTA	2	6	23132	23137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022665	AGC	2	6	23149	23154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022665	TCG	2	6	23163	23168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022665	CGG	2	6	23275	23280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022665	TAT	2	6	23323	23328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022665	GGT	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022665	ATATT	2	10	23405	23414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022665	AT	3	6	23558	23563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022665	TAA	2	6	24912	24917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022665	T	7	7	24939	24945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022665	GA	3	6	24954	24959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022665	GAG	2	6	24973	24978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022665	TTTG	2	8	26286	26293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022665	AT	3	6	26333	26338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022665	AGG	2	6	26339	26344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022665	CTT	2	6	27341	27346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022665	T	6	6	27345	27350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022665	ATTT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022665	TAT	2	6	27369	27374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022665	T	6	6	30618	30623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022665	AAC	2	6	30628	30633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022665	TGT	2	6	30642	30647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022665	TG	3	6	30660	30665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_022665	ATTT	2	8	45521	45528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_022665	ATTG	2	8	50223	50230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022665	GAAA	2	8	50259	50266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022665	TTACA	2	10	50359	50368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_022665	TTTA	2	8	94849	94856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022665	T	6	6	94917	94922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_022665	TACT	2	8	94960	94967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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